ऑल इंडिया मुस्लिम पर्सनल लॉ बोर्ड, धार्मिक और राष्ट्रीय मुस्लिम संगठनों और मदरसों के नेताओं ने एक संयुक्त बयान में विभिन्न राज्यों में मदरसों को कमजोर करने के प्रयासों की निंदा की है और कहा है कि उनके संस्थानों पर कार्रवाई बर्दाश्त नहीं की जाएगी। बयान में कहा गया है कि हम, देश के नागरिक, विभिन्न बहानों से उत्तर प्रदेश, मध्य प्रदेश और अन्य राज्यों में मदरसों की स्थिति और पहचान को कमजोर करने के प्रयासों की कड़ी निंदा करते हैं। हम स्पष्ट रूप से कहते हैं कि राष्ट्रीय बाल अधिकार संरक्षण आयोग द्वारा अल्पसंख्यक शैक्षणिक संस्थानों यानी मदरसों के संबंध में राज्य सरकारों को जारी किए गए निर्देश अवैध हैं और आयोग के अधिकार क्षेत्र से परे हैं।यह तब आया है जब उत्तर प्रदेश के मुख्य सचिव ने जिला अधिकारियों को मदरसों का सर्वेक्षण करने और छात्रों को “गैर-मान्यता प्राप्त स्कूलों” (स्वतंत्र मदरसा) से सरकारी स्कूलों में स्थानांतरित करने का निर्देश दिया है। 8,449 “गैर-मान्यता प्राप्त स्कूलों” स्वतंत्र मदरसों की एक सूची प्रकाशित की गई है, जिसमें दारुल उलूम देवबंद, दारुल उलूम नदवातुल उलेमा, लखनऊ, मजाहिर उलूम सहारनपुर, जामिया सलाफिया वाराणसी, जामिया अशरफिया मुबारकपुर, मदरसतुल इस्लाह सरायमीर, और जामिया अल फलाह बलेरियागंज जैसे प्रसिद्ध और ऐतिहासिक संस्थान शामिल हैं।
जिला मजिस्ट्रेट इन संस्थानों से छात्रों को सरकारी स्कूलों में स्थानांतरित करने के लिए दबाव डाल रहे हैं। मुख्य सचिव का यह सर्कुलर और जिला अधिकारियों का दबाव पूरी तरह से अवैध है। संयुक्त बयान में कहा गया है कि इसके अतिरिक्त, जिला प्रशासन ने गैर-मुस्लिम छात्रों को इन स्कूलों से हटाकर सरकारी स्कूलों में स्थानांतरित कर दिया है, जो उनके चुनने के व्यक्तिगत अधिकार और हमारी संयुक्त भारतीय संस्कृति और सभ्यता पर हमला है।
अब मुस्लिम छात्रों पर भी शिक्षा का अधिकार कानून के तहत बुनियादी शिक्षा हासिल करने का दबाव डाला जा रहा है. उन्होंने कहा कि अनुपालन न करने की स्थिति में इन मदरसों के प्रशासकों को कार्रवाई की धमकी दी जा रही है। मध्य प्रदेश में, सरकार ने एक कदम आगे बढ़ाते हुए मदरसों में छात्रों को प्रतिदिन सरस्वती वंदना करने के लिए बाध्य किया है। संयुक्त बयान में कहा गया है.हम, मुस्लिम धार्मिक और राष्ट्रीय संगठनों के जिम्मेदार सदस्य, और धार्मिक स्कूलों और विश्वविद्यालयों के प्रमुख, यह स्पष्ट करना आवश्यक समझते हैं कि संविधान के अनुच्छेद 30(1) के तहत, अल्पसंख्यकों को अपने शैक्षणिक संस्थानों की स्थापना और प्रशासन करने का मौलिक अधिकार है।